MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1034rc

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187137	A	7	7	6631	6637	100 %	0 %	0 %	0 %	426202325
2	NT_187137	AAT	2	6	6657	6662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202325
3	NT_187137	TAA	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202325
4	NT_187137	ATG	3	9	6685	6693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202325
5	NT_187137	GTT	2	6	6697	6702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202325
6	NT_187137	ACA	2	6	6720	6725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202325
7	NT_187137	AGC	2	6	6747	6752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202325
8	NT_187137	AGG	2	6	6753	6758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202325
9	NT_187137	AGTT	2	8	6842	6849	25 %	50 %	25 %	0 %	426202325
10	NT_187137	AAAG	2	8	6885	6892	75 %	0 %	25 %	0 %	426202325
11	NT_187137	GGT	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202325
12	NT_187137	A	6	6	6966	6971	100 %	0 %	0 %	0 %	426202325
13	NT_187137	A	7	7	6989	6995	100 %	0 %	0 %	0 %	426202325
14	NT_187137	A	6	6	7005	7010	100 %	0 %	0 %	0 %	426202325
15	NT_187137	AAG	2	6	7039	7044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202325
16	NT_187137	AAT	2	6	7120	7125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202325
17	NT_187137	AGC	2	6	7134	7139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202325
18	NT_187137	AAAG	2	8	7158	7165	75 %	0 %	25 %	0 %	426202325
19	NT_187137	AAT	2	6	7185	7190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202325
20	NT_187137	CAG	2	6	7196	7201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202325
21	NT_187137	AGGT	2	8	7247	7254	25 %	25 %	50 %	0 %	426202325
22	NT_187137	ATA	2	6	7265	7270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202325
23	NT_187137	GCA	2	6	7306	7311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202325
24	NT_187137	GCA	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202325
25	NT_187137	AAC	2	6	7344	7349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202325
26	NT_187137	AGA	2	6	7392	7397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202325
27	NT_187137	AGG	2	6	7458	7463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202325
28	NT_187137	AGC	3	9	7500	7508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202325
29	NT_187137	AGG	2	6	7515	7520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202325
30	NT_187137	GGT	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202325
31	NT_187137	AAT	3	9	7564	7572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202325
32	NT_187137	GAT	2	6	7573	7578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202325
33	NT_187137	AAAT	2	8	7614	7621	75 %	25 %	0 %	0 %	426202325
34	NT_187137	TAG	2	6	7625	7630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202325
35	NT_187137	CAG	2	6	7715	7720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202325
36	NT_187137	AGAT	2	8	7731	7738	50 %	25 %	25 %	0 %	426202325
37	NT_187137	AAT	2	6	13350	13355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202326
38	NT_187137	TAA	2	6	13373	13378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202326
39	NT_187137	TAA	2	6	13396	13401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202326
40	NT_187137	ATT	2	6	13565	13570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202326
41	NT_187137	TAT	2	6	13588	13593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202326
42	NT_187137	ATT	2	6	13652	13657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202326
43	NT_187137	TAT	2	6	13675	13680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202326
44	NT_187137	ATT	2	6	13739	13744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202326
45	NT_187137	TAT	2	6	13762	13767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202326
46	NT_187137	ATT	2	6	13826	13831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202326
47	NT_187137	GCTT	2	8	13880	13887	0 %	50 %	25 %	25 %	426202326
48	NT_187137	TTA	2	6	13893	13898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202326
49	NT_187137	TAAG	2	8	13974	13981	50 %	25 %	25 %	0 %	426202326
50	NT_187137	ATA	2	6	13991	13996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202326
51	NT_187137	TTG	2	6	14063	14068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202326
52	NT_187137	GA	3	6	14143	14148	50 %	0 %	50 %	0 %	426202327
53	NT_187137	GTT	2	6	14152	14157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202327
54	NT_187137	TAAT	2	8	14181	14188	50 %	50 %	0 %	0 %	426202327
55	NT_187137	GTT	2	6	14194	14199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202327
56	NT_187137	GCA	2	6	14280	14285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202327
57	NT_187137	TAT	2	6	14302	14307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202327
58	NT_187137	GTAT	2	8	14337	14344	25 %	50 %	25 %	0 %	426202327
59	NT_187137	TAA	2	6	14365	14370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202327
60	NT_187137	AGT	2	6	14399	14404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202327
61	NT_187137	T	6	6	14475	14480	0 %	100 %	0 %	0 %	426202327
62	NT_187137	GGA	2	6	14486	14491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202327
63	NT_187137	T	6	6	14552	14557	0 %	100 %	0 %	0 %	426202327
64	NT_187137	CAAG	2	8	14577	14584	50 %	0 %	25 %	25 %	426202327
65	NT_187137	TAG	2	6	14587	14592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202327
66	NT_187137	T	6	6	14601	14606	0 %	100 %	0 %	0 %	426202327
67	NT_187137	AAGCA	2	10	14642	14651	60 %	0 %	20 %	20 %	426202327
68	NT_187137	AGA	2	6	14672	14677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202327
69	NT_187137	ATA	2	6	14691	14696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202327

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.